養殖廢水首要包含飼養沖洗時的糞、尿、剩余藥劑混合水以及部分日子污水，水質水量變化大，懸浮物多、有機物濃度高、氨氮濃度高、含有重金屬、致病菌并有惡臭。很多懸浮物沉積，會使土壤孔隙阻塞，形成土壤透氣、透水性下降；
高濃度有機物及氨氮，會使土壤養分失衡，導致土壤板結、鹽化，耗費水體溶解氧，會引起水體發黑、變臭；畜禽飼料常有的鋅、銅等重金屬則易在土壤中積累，導致土壤重金屬超支，影響作物成長；
畜禽糞尿排泄物帶有的致病微生物、寄生蟲卵經過水源或蚊蠅傳達，易引起感染，乃至引發疫情；畜禽糞尿排泄物伴有的H2S、NH3等氣體，會發生胺、硫等惡臭氣體，嚴峻影響周邊環境。
養殖場發生的糞污排放形成地表水、地下水、土壤和環境空氣的嚴峻污染， 直接影響了人們的身體健康，而未經處理的糞污中含有很多污染物質， 若此種有機廢水直接排入或隨雨水沖刷進入江河湖庫，很多耗費水體中的溶解氧，使水質變黑發臭，形成水體污染。
糞污水中含有很多的n、p 等養分物是形成水體富養分化的重要原因之一， 排入魚塘及河流使對有機物污染敏感的水生生物逐漸逝世， 嚴峻者導致魚塘及河流喪失使用功能。
飼養污水長期滲入地下， 使地下水中的硝態氮或亞硝態氮濃度增高， 地下水溶解氧含量削減， 有毒成分增多， 導致水質惡化，嚴峻危及周邊日子用水的水質。高濃度污水還可導致土壤孔隙阻塞， 形成土壤透氣、透水性下降及板結、鹽化， 嚴峻降低土壤質量， 乃至傷害農作物， 形成農作物成長受阻或逝世。
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